出現紀錄

Nansen Legacy Bacterial and Archaeal community composition

最新版本 由 The Nansen Legacy Project 發佈於 2023年3月23日 The Nansen Legacy Project
The bacterial and archaeal community composition based on 16S rRNA metabarcoding of seawater samples taken along the transect of the Nansen Legacy project (https://www.wikidata.org/wiki/Q110857128) from 2018 to 2021. The samples contain 7 datasets from different cruises at different time points. From the samples the DNA was extracted and then used for 16S rRNA gene sequencing using the standard Earth Microbiome Project primers (515F and 806R) and Illumina MiSeq paired end sequencing. The raw sequences were run using the DADA2 pipeline (Callahan et al., 2016) and then cleaned for samples with under a total of 10000 sequences and ASVs with less than a total of 3 sequences per sequencing run or 0.0001% relative abundance.
首頁:
連結
發布日期:
2023年3月23日
授權條款:
CC-BY 4.0

資料紀錄

此資源出現紀錄的資料已發佈為達爾文核心集檔案（DwC-A），其以一或多組資料表構成分享生物多樣性資料的標準格式。 核心資料表包含 531,878 筆紀錄。

亦存在 1 筆延伸集的資料表。延伸集中的紀錄補充核心集中紀錄的額外資訊。 每個延伸集資料表中資料筆數顯示如下。

  • Occurrence (核心)
    531878
  • ExtendedMeasurementOrFact 
    531878

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版本

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如何引用

研究者應依照以下指示引用此資源。:

Thiele S (2023): Nansen Legacy Bacterial and Archaeal community composition. v1.3. The Nansen Legacy Project. Dataset/Occurrence. 10.21335/NMDC-831634754

權利

研究者應尊重以下權利聲明。:

此資料的發布者及權利單位為 The Nansen Legacy Project。 This work is licensed under a Creative Commons Attribution (CC-BY) 4.0 License.

GBIF 註冊

此資源已向GBIF註冊，並指定以下之GBIF UUID: 6657cf69-cda9-4538-9146-6e30428e9dbb。  The Nansen Legacy Project 發佈此資源，並經由GBIF Norway同意向GBIF註冊成為資料發佈者。

關鍵字

The Nansen Legacy; Barents Sea; Bacteria; Archaea; marine; Arctic

聯絡資訊

資源建立者:

Stefan Thiele
Postdoc
University of Bergen
Thormohlensgate 53 A/B
5006 Bergen
Vestland
NO

可回覆此資源相關問題者:

Stefan Thiele
Postdoc
University of Bergen
Thormohlensgate 53 A/B
5006 Bergen
Vestland
NO

元數據填寫者:

Stefan Thiele
Postdoc
University of Bergen
Thormohlensgate 53 A/B
5006 Bergen
Vestland
NO

與此資源的相關者:

使用者
Stefan Thiele
Postdoc
University of Bergen
Thormohlensgate 53 A/B
5006 Bergen
Vestland
NO

地理涵蓋範圍

Northern Barents Sea, east of Svalbard, Norway.

界定座標範圍 緯度南界 經度西界 [75.996, 28.504], 緯度北界 經度東界 [82.092, 34.274]

分類群涵蓋範圍

Bacteria and Archaea based on 16S rRNA gene sequence.

Domain  Bacteria and Archaea

時間涵蓋範圍

起始日期 / 結束日期 2018-08-01 / 2021-08-31

取樣方法

Please refer to the Nansen Legacy Sampling Protocol: https://arvenetternansen.com/sampling-protocol-collection/

研究範圍 The samples were taken on 7 cruises along the Nansen Legacy Project transect in the Northern Barents Sea.

方法步驟描述:

  1. Please refer to the Nansen Legacy Sampling Protocol: https://arvenetternansen.com/sampling-protocol-collection/

額外的詮釋資料

替代的識別碼 6657cf69-cda9-4538-9146-6e30428e9dbb
https://gbif.imr.no/ipt/resource?r=uib_aen_rrna_2023