Occurrence

Nansen Legacy Bacterial and Archaeal community composition

Последняя версия опубликована The Nansen Legacy Project 23 марта 2023 г. The Nansen Legacy Project
The bacterial and archaeal community composition based on 16S rRNA metabarcoding of seawater samples taken along the transect of the Nansen Legacy project (https://www.wikidata.org/wiki/Q110857128) from 2018 to 2021. The samples contain 7 datasets from different cruises at different time points. From the samples the DNA was extracted and then used for 16S rRNA gene sequencing using the standard Earth Microbiome Project primers (515F and 806R) and Illumina MiSeq paired end sequencing. The raw sequences were run using the DADA2 pipeline (Callahan et al., 2016) and then cleaned for samples with under a total of 10000 sequences and ASVs with less than a total of 3 sequences per sequencing run or 0.0001% relative abundance.
Домой:
Ссылка
Дата публикации:
23 марта 2023 г.
Техническое обеспечение:
The Nansen Legacy Project
Лицензия:
CC-BY 4.0

Записи данных

Данные этого occurrence ресурса были опубликованы в виде Darwin Core Archive (DwC-A), который является стандартным форматом для обмена данными о биоразнообразии в виде набора из одной или нескольких таблиц. Основная таблица данных содержит 531 878 записей.

Также в наличии 1 таблиц с данными расширений. Записи расширений содержат дополнительную информацию об основной записи. Число записей в каждой таблице данных расширения показано ниже.

  • Occurrence (core)
    531878
  • ExtendedMeasurementOrFact 
    531878

Данный экземпляр IPT архивирует данные и таким образом служит хранилищем данных. Данные и метаданные ресурсов доступны для скачивания в разделе Загрузки. В таблице версий перечислены другие версии ресурса, которые были доступны публично, что позволяет отслеживать изменения, внесенные в ресурс с течением времени.

Загрузки

Скачайте последнюю версию данных этого ресурса в формате Darwin Core Archive (DwC-A) или метаданных ресурса в форматах EML или RTF:

Данные в формате DwC-A Скачать 531 878 Записи в English (33 MB) - Частота обновления: unknown
Метаданные в формате EML Скачать в English (8 kB)
Метаданные в формате RTF Скачать в English (7 kB)

Версии

В таблице ниже указаны только опубликованные версии ресурса, которые доступны для свободного скачивания.

Как оформить ссылку

Исследователи должны дать ссылку на эту работу следующим образом:

Thiele S (2023): Nansen Legacy Bacterial and Archaeal community composition. v1.3. The Nansen Legacy Project. Dataset/Occurrence. 10.21335/NMDC-831634754

Права

Исследователи должны соблюдать следующие права:

Публикующей организацией и владельцем прав на данную работу является The Nansen Legacy Project. This work is licensed under a Creative Commons Attribution (CC-BY) 4.0 License.

Регистрация в GBIF

Этот ресурс был зарегистрирован в GBIF, ему был присвоен следующий UUID: 6657cf69-cda9-4538-9146-6e30428e9dbb.  The Nansen Legacy Project отвечает за публикацию этого ресурса, и зарегистрирован в GBIF как издатель данных при оподдержке GBIF Norway.

Ключевые слова

The Nansen Legacy; Barents Sea; Bacteria; Archaea; marine; Arctic

Контакты

Кто является создателем ресурса:

Stefan Thiele
Postdoc
University of Bergen
Thormohlensgate 53 A/B
5006 Bergen
Vestland
NO

Кто может ответить на вопросы о ресурсе:

Stefan Thiele
Postdoc
University of Bergen
Thormohlensgate 53 A/B
5006 Bergen
Vestland
NO

Кем заполнены метаданные:

Stefan Thiele
Postdoc
University of Bergen
Thormohlensgate 53 A/B
5006 Bergen
Vestland
NO

Кто еще связан с данным ресурсом:

User
Stefan Thiele
Postdoc
University of Bergen
Thormohlensgate 53 A/B
5006 Bergen
Vestland
NO

Географический охват

Northern Barents Sea, east of Svalbard, Norway.

Ограничивающие координаты Юг Запад [75,996, 28,504], Север Восток [82,092, 34,274]

Таксономический охват

Bacteria and Archaea based on 16S rRNA gene sequence.

Domain  Bacteria and Archaea

Временной охват

Дата начала / Дата окончания 2018-08-01 / 2021-08-31

Методы сбора

Please refer to the Nansen Legacy Sampling Protocol: https://arvenetternansen.com/sampling-protocol-collection/

Охват исследования The samples were taken on 7 cruises along the Nansen Legacy Project transect in the Northern Barents Sea.

Описание этапа методики:

  1. Please refer to the Nansen Legacy Sampling Protocol: https://arvenetternansen.com/sampling-protocol-collection/

Дополнительные метаданные

Альтернативные идентификаторы 6657cf69-cda9-4538-9146-6e30428e9dbb
https://gbif.imr.no/ipt/resource?r=uib_aen_rrna_2023