オカレンス（観察データと標本)

Nansen Legacy Bacterial and Archaeal community composition

最新バージョン The Nansen Legacy Project によって公開 2023/03/23 The Nansen Legacy Project
The bacterial and archaeal community composition based on 16S rRNA metabarcoding of seawater samples taken along the transect of the Nansen Legacy project (https://www.wikidata.org/wiki/Q110857128) from 2018 to 2021. The samples contain 7 datasets from different cruises at different time points. From the samples the DNA was extracted and then used for 16S rRNA gene sequencing using the standard Earth Microbiome Project primers (515F and 806R) and Illumina MiSeq paired end sequencing. The raw sequences were run using the DADA2 pipeline (Callahan et al., 2016) and then cleaned for samples with under a total of 10000 sequences and ASVs with less than a total of 3 sequences per sequencing run or 0.0001% relative abundance.
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公開日:
2023/03/23
ライセンス:
CC-BY 4.0

データ レコード

この オカレンス（観察データと標本) リソース内のデータは、1 つまたは複数のデータ テーブルとして生物多様性データを共有するための標準化された形式であるダーウィン コア アーカイブ (DwC-A) として公開されています。 コア データ テーブルには、531,878 レコードが含まれています。

拡張データ テーブルは1 件存在しています。拡張レコードは、コアのレコードについての追加情報を提供するものです。 各拡張データ テーブル内のレコード数を以下に示します。

  • Occurrence (コア)
    531878
  • ExtendedMeasurementOrFact 
    531878

この IPT はデータをアーカイブし、データ リポジトリとして機能します。データとリソースのメタデータは、 ダウンロード セクションからダウンロードできます。 バージョン テーブルから公開可能な他のバージョンを閲覧でき、リソースに加えられた変更を知ることができます。

ダウンロード

DwC-A形式のリソース データまたは EML / RTF 形式のリソース メタデータの最新バージョンをダウンロード：

DwC ファイルとしてのデータ ダウンロード 531,878 レコード English で (33 MB) - 更新頻度: unknown
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RTF ファイルとしてのメタデータ ダウンロード English で (7 kB)

バージョン

次の表は、公にアクセス可能な公開バージョンのリソースのみ表示しています。

引用方法

研究者はこの研究内容を以下のように引用する必要があります。:

Thiele S (2023): Nansen Legacy Bacterial and Archaeal community composition. v1.3. The Nansen Legacy Project. Dataset/Occurrence. 10.21335/NMDC-831634754

権利

研究者は権利に関する下記ステートメントを尊重する必要があります。:

パブリッシャーとライセンス保持者権利者は The Nansen Legacy Project。 This work is licensed under a Creative Commons Attribution (CC-BY) 4.0 License.

GBIF登録

このリソースをはGBIF と登録されており GBIF UUID: 6657cf69-cda9-4538-9146-6e30428e9dbbが割り当てられています。   GBIF Norway によって承認されたデータ パブリッシャーとして GBIF に登録されているThe Nansen Legacy Project が、このリソースをパブリッシュしました。

キーワード

The Nansen Legacy; Barents Sea; Bacteria; Archaea; marine; Arctic

連絡先

リソースを作成した人:

Stefan Thiele
Postdoc
University of Bergen
Thormohlensgate 53 A/B
5006 Bergen
Vestland
NO

リソースに関する質問に答えることができる人:

Stefan Thiele
Postdoc
University of Bergen
Thormohlensgate 53 A/B
5006 Bergen
Vestland
NO

メタデータを記載した人:

Stefan Thiele
Postdoc
University of Bergen
Thormohlensgate 53 A/B
5006 Bergen
Vestland
NO

他に、リソースに関連付けられていた人:

データ利用者
Stefan Thiele
Postdoc
University of Bergen
Thormohlensgate 53 A/B
5006 Bergen
Vestland
NO

地理的範囲

Northern Barents Sea, east of Svalbard, Norway.

座標（緯度経度） 南 西 [75.996, 28.504], 北 東 [82.092, 34.274]

生物分類学的範囲

Bacteria and Archaea based on 16S rRNA gene sequence.

Domain  Bacteria and Archaea

時間的範囲

開始日 / 終了日 2018-08-01 / 2021-08-31

収集方法

Please refer to the Nansen Legacy Sampling Protocol: https://arvenetternansen.com/sampling-protocol-collection/

Study Extent The samples were taken on 7 cruises along the Nansen Legacy Project transect in the Northern Barents Sea.

Method step description:

  1. Please refer to the Nansen Legacy Sampling Protocol: https://arvenetternansen.com/sampling-protocol-collection/

追加のメタデータ

代替識別子 6657cf69-cda9-4538-9146-6e30428e9dbb
https://gbif.imr.no/ipt/resource?r=uib_aen_rrna_2023