Ocorrência

Nansen Legacy Bacterial and Archaeal community composition

Versão mais recente publicado por The Nansen Legacy Project em 23 de Março de 2023 The Nansen Legacy Project
The bacterial and archaeal community composition based on 16S rRNA metabarcoding of seawater samples taken along the transect of the Nansen Legacy project (https://www.wikidata.org/wiki/Q110857128) from 2018 to 2021. The samples contain 7 datasets from different cruises at different time points. From the samples the DNA was extracted and then used for 16S rRNA gene sequencing using the standard Earth Microbiome Project primers (515F and 806R) and Illumina MiSeq paired end sequencing. The raw sequences were run using the DADA2 pipeline (Callahan et al., 2016) and then cleaned for samples with under a total of 10000 sequences and ASVs with less than a total of 3 sequences per sequencing run or 0.0001% relative abundance.
Início:
Link
Publication date:
23 de Março de 2023
License:
CC-BY 4.0

Registros de Dados

Os dados deste recurso de ocorrência foram publicados como um Darwin Core Archive (DwC-A), que é o formato padronizado para compartilhamento de dados de biodiversidade como um conjunto de uma ou mais tabelas de dados. A tabela de dados do núcleo contém 531.878 registros.

Também existem 1 tabelas de dados de extensão. Um registro de extensão fornece informações adicionais sobre um registro do núcleo. O número de registros em cada tabela de dados de extensão é ilustrado abaixo.

  • Occurrence (core)
    531878
  • ExtendedMeasurementOrFact 
    531878

This IPT archives the data and thus serves as the data repository. The data and resource metadata are available for download in the downloads section. The versions table lists other versions of the resource that have been made publicly available and allows tracking changes made to the resource over time.

Downloads

Baixe a última versão do recurso de dados, como um Darwin Core Archive (DwC-A) ou recurso de metadados, como EML ou RTF:

Dados como um arquivo DwC-A download 531.878 registros em English (33 MB) - Frequência de atualização: desconhecido
Metadados como um arquivo EML download em English (8 kB)
Metadados como um arquivo RTF download em English (7 kB)

Versões

A tabela abaixo mostra apenas versões de recursos que são publicamente acessíveis.

Como citar

Pesquisadores deveriam citar esta obra da seguinte maneira:

Thiele S (2023): Nansen Legacy Bacterial and Archaeal community composition. v1.3. The Nansen Legacy Project. Dataset/Occurrence. 10.21335/NMDC-831634754

Direitos

Pesquisadores devem respeitar a seguinte declaração de direitos:

O editor e o detentor dos direitos deste trabalho é The Nansen Legacy Project. This work is licensed under a Creative Commons Attribution (CC-BY) 4.0 License.

GBIF Registration

Este recurso foi registrado no GBIF e atribuído ao seguinte GBIF UUID: 6657cf69-cda9-4538-9146-6e30428e9dbb.  The Nansen Legacy Project publica este recurso, e está registrado no GBIF como um publicador de dados aprovado por GBIF Norway.

Palavras-chave

The Nansen Legacy; Barents Sea; Bacteria; Archaea; marine; Arctic

Contatos

Quem criou esse recurso:

Stefan Thiele
Postdoc
University of Bergen
Thormohlensgate 53 A/B
5006 Bergen
Vestland
NO

Quem pode responder a perguntas sobre o recurso:

Stefan Thiele
Postdoc
University of Bergen
Thormohlensgate 53 A/B
5006 Bergen
Vestland
NO

Quem preencher os metadados:

Stefan Thiele
Postdoc
University of Bergen
Thormohlensgate 53 A/B
5006 Bergen
Vestland
NO

Quem mais foi associado com o recurso:

Usuário
Stefan Thiele
Postdoc
University of Bergen
Thormohlensgate 53 A/B
5006 Bergen
Vestland
NO

Cobertura Geográfica

Northern Barents Sea, east of Svalbard, Norway.

Coordenadas delimitadoras Sul Oeste [75,996, 28,504], Norte Leste [82,092, 34,274]

Cobertura Taxonômica

Bacteria and Archaea based on 16S rRNA gene sequence.

Domínio  Bacteria and Archaea

Cobertura Temporal

Data Inicial / Data final 2018-08-01 / 2021-08-31

Métodos de Amostragem

Please refer to the Nansen Legacy Sampling Protocol: https://arvenetternansen.com/sampling-protocol-collection/

Área de Estudo The samples were taken on 7 cruises along the Nansen Legacy Project transect in the Northern Barents Sea.

Descrição dos passos do método:

  1. Please refer to the Nansen Legacy Sampling Protocol: https://arvenetternansen.com/sampling-protocol-collection/

Metadados Adicionais

Identificadores alternativos 6657cf69-cda9-4538-9146-6e30428e9dbb
https://gbif.imr.no/ipt/resource?r=uib_aen_rrna_2023