Registros biológicos

Nansen Legacy Bacterial and Archaeal community composition

Última versión Publicado por The Nansen Legacy Project en 23 de marzo de 2023 The Nansen Legacy Project
The bacterial and archaeal community composition based on 16S rRNA metabarcoding of seawater samples taken along the transect of the Nansen Legacy project (https://www.wikidata.org/wiki/Q110857128) from 2018 to 2021. The samples contain 7 datasets from different cruises at different time points. From the samples the DNA was extracted and then used for 16S rRNA gene sequencing using the standard Earth Microbiome Project primers (515F and 806R) and Illumina MiSeq paired end sequencing. The raw sequences were run using the DADA2 pipeline (Callahan et al., 2016) and then cleaned for samples with under a total of 10000 sequences and ASVs with less than a total of 3 sequences per sequencing run or 0.0001% relative abundance.
Inicio:
Enlace
Fecha de publicación:
23 de marzo de 2023
Licencia:
CC-BY 4.0

Registros

Los datos en este recurso de registros biológicos han sido publicados como Archivo Darwin Core(DwC-A), el cual es un formato estándar para compartir datos de biodiversidad como un conjunto de una o más tablas de datos. La tabla de datos del core contiene 531.878 registros.

también existen 1 tablas de datos de extensiones. Un registro en una extensión provee información adicional sobre un registro en el core. El número de registros en cada tabla de datos de la extensión se ilustra a continuación.

  • Occurrence (core)
    531878
  • ExtendedMeasurementOrFact 
    531878

Este IPT archiva los datos y, por lo tanto, sirve como repositorio de datos. Los datos y los metadatos del recurso están disponibles para su descarga en la sección descargas. La tabla versiones enumera otras versiones del recurso que se han puesto a disposición del público y permite seguir los cambios realizados en el recurso a lo largo del tiempo.

Descargas

Descargue la última versión de los datos como un Archivo Darwin Core (DwC-A) o los metadatos como EML o RTF:

Datos como un archivo DwC-A descargar 531.878 registros en Inglés (33 MB) - Frecuencia de actualización: desconocido
Metadatos como un archivo EML descargar en Inglés (8 kB)
Metadatos como un archivo RTF descargar en Inglés (7 kB)

Versiones

La siguiente tabla muestra sólo las versiones publicadas del recurso que son de acceso público.

¿Cómo referenciar?

Los usuarios deben citar este trabajo de la siguiente manera:

Thiele S (2023): Nansen Legacy Bacterial and Archaeal community composition. v1.3. The Nansen Legacy Project. Dataset/Occurrence. 10.21335/NMDC-831634754

Derechos

Los usuarios deben respetar los siguientes derechos de uso:

El publicador y propietario de los derechos de este trabajo es The Nansen Legacy Project. Este trabajo está autorizado bajo una Licencia Creative Commons Atribución/Reconocimiento 4.0 Internacional (CC-BY) 4.0.

Registro GBIF

Este recurso ha sido registrado en GBIF con el siguiente UUID: 6657cf69-cda9-4538-9146-6e30428e9dbb.  The Nansen Legacy Project publica este recurso y está registrado en GBIF como un publicador de datos avalado por GBIF Norway.

Palabras clave

The Nansen Legacy; Barents Sea; Bacteria; Archaea; marine; Arctic

Contactos

¿Quién creó el recurso?:

Stefan Thiele
Postdoc
University of Bergen
Thormohlensgate 53 A/B
5006 Bergen
Vestland
NO

¿Quién puede resolver dudas acerca del recurso?:

Stefan Thiele
Postdoc
University of Bergen
Thormohlensgate 53 A/B
5006 Bergen
Vestland
NO

¿Quién documentó los metadatos?:

Stefan Thiele
Postdoc
University of Bergen
Thormohlensgate 53 A/B
5006 Bergen
Vestland
NO

¿Quién más está asociado con el recurso?:

Usuario
Stefan Thiele
Postdoc
University of Bergen
Thormohlensgate 53 A/B
5006 Bergen
Vestland
NO

Cobertura geográfica

Northern Barents Sea, east of Svalbard, Norway.

Coordenadas límite Latitud Mínima Longitud Mínima [75,996, 28,504], Latitud Máxima Longitud Máxima [82,092, 34,274]

Cobertura taxonómica

Bacteria and Archaea based on 16S rRNA gene sequence.

Dominio  Bacteria and Archaea

Cobertura temporal

Fecha Inicial / Fecha Final 2018-08-01 / 2021-08-31

Métodos de muestreo

Please refer to the Nansen Legacy Sampling Protocol: https://arvenetternansen.com/sampling-protocol-collection/

Área de Estudio The samples were taken on 7 cruises along the Nansen Legacy Project transect in the Northern Barents Sea.

Descripción de la metodología paso a paso:

  1. Please refer to the Nansen Legacy Sampling Protocol: https://arvenetternansen.com/sampling-protocol-collection/

Metadatos adicionales

Identificadores alternativos 6657cf69-cda9-4538-9146-6e30428e9dbb
https://gbif.imr.no/ipt/resource?r=uib_aen_rrna_2023