Occurrence

Nansen Legacy Bacterial and Archaeal community composition

Dernière version Publié par The Nansen Legacy Project le 23 mars 2023 The Nansen Legacy Project
The bacterial and archaeal community composition based on 16S rRNA metabarcoding of seawater samples taken along the transect of the Nansen Legacy project (https://www.wikidata.org/wiki/Q110857128) from 2018 to 2021. The samples contain 7 datasets from different cruises at different time points. From the samples the DNA was extracted and then used for 16S rRNA gene sequencing using the standard Earth Microbiome Project primers (515F and 806R) and Illumina MiSeq paired end sequencing. The raw sequences were run using the DADA2 pipeline (Callahan et al., 2016) and then cleaned for samples with under a total of 10000 sequences and ASVs with less than a total of 3 sequences per sequencing run or 0.0001% relative abundance.
Accueil:
Lien
Date de publication:
23 mars 2023
Hébergé par:
The Nansen Legacy Project
Licence:
CC-BY 4.0

Enregistrements de données

Les données de cette ressource occurrence ont été publiées sous forme d'une Archive Darwin Core (Darwin Core Archive ou DwC-A), le format standard pour partager des données de biodiversité en tant qu'ensemble d'un ou plusieurs tableurs de données. Le tableur de données du cœur de standard (core) contient 531 878 enregistrements.

1 tableurs de données d'extension existent également. Un enregistrement d'extension fournit des informations supplémentaires sur un enregistrement du cœur de standard (core). Le nombre d'enregistrements dans chaque tableur de données d'extension est illustré ci-dessous.

  • Occurrence (noyau)
    531878
  • ExtendedMeasurementOrFact 
    531878

Cet IPT archive les données et sert donc de dépôt de données. Les données et métadonnées de la ressource sont disponibles pour téléchargement dans la section téléchargements. Le tableau des versions liste les autres versions de chaque ressource rendues disponibles de façon publique et permet de tracer les modifications apportées à la ressource au fil du temps.

Téléchargements

Téléchargez la dernière version de la ressource en tant qu'Archive Darwin Core (DwC-A), ou les métadonnées de la ressource au format EML ou RTF :

Données sous forme de fichier DwC-A (zip) télécharger 531 878 enregistrements dans Anglais (33 MB) - Fréquence de mise à jour: inconnue
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Métadonnées sous forme de fichier RTF télécharger dans Anglais (7 kB)

Versions

Le tableau ci-dessous n'affiche que les versions publiées de la ressource accessibles publiquement.

Comment citer

Les chercheurs doivent citer cette ressource comme suit:

Thiele S (2023): Nansen Legacy Bacterial and Archaeal community composition. v1.3. The Nansen Legacy Project. Dataset/Occurrence. 10.21335/NMDC-831634754

Droits

Les chercheurs doivent respecter la déclaration de droits suivante:

L’éditeur et détenteur des droits de cette ressource est The Nansen Legacy Project. Ce travail est sous licence Creative Commons Attribution (CC-BY) 4.0.

Enregistrement GBIF

Cette ressource a été enregistrée sur le portail GBIF, et possède l'UUID GBIF suivante : 6657cf69-cda9-4538-9146-6e30428e9dbb.  The Nansen Legacy Project publie cette ressource, et est enregistré dans le GBIF comme éditeur de données avec l'approbation du GBIF Norway.

Mots-clé

The Nansen Legacy; Barents Sea; Bacteria; Archaea; marine; Arctic

Contacts

Personne ayant créé cette ressource:

Stefan Thiele
Postdoc
University of Bergen
Thormohlensgate 53 A/B
5006 Bergen
Vestland
NO

Personne pouvant répondre aux questions sur la ressource:

Stefan Thiele
Postdoc
University of Bergen
Thormohlensgate 53 A/B
5006 Bergen
Vestland
NO

Personne ayant renseigné les métadonnées:

Stefan Thiele
Postdoc
University of Bergen
Thormohlensgate 53 A/B
5006 Bergen
Vestland
NO

Autres personnes associées à la ressource:

Utilisateur
Stefan Thiele
Postdoc
University of Bergen
Thormohlensgate 53 A/B
5006 Bergen
Vestland
NO

Couverture géographique

Northern Barents Sea, east of Svalbard, Norway.

Enveloppe géographique Sud Ouest [75,996, 28,504], Nord Est [82,092, 34,274]

Couverture taxonomique

Bacteria and Archaea based on 16S rRNA gene sequence.

Domain  Bacteria and Archaea

Couverture temporelle

Date de début / Date de fin 2018-08-01 / 2021-08-31

Méthodes d'échantillonnage

Please refer to the Nansen Legacy Sampling Protocol: https://arvenetternansen.com/sampling-protocol-collection/

Etendue de l'étude The samples were taken on 7 cruises along the Nansen Legacy Project transect in the Northern Barents Sea.

Description des étapes de la méthode:

  1. Please refer to the Nansen Legacy Sampling Protocol: https://arvenetternansen.com/sampling-protocol-collection/

Métadonnées additionnelles

Identifiants alternatifs 6657cf69-cda9-4538-9146-6e30428e9dbb
https://gbif.imr.no/ipt/resource?r=uib_aen_rrna_2023